新型コロナウイルス関連発表論文一覧

【2022年12月】
Humoral immune evasion of the omicron subvariants BQ.1.1 and XBB
Lancet Infectious Diseases オンライン版 2022年12月7日
doi:10.1016/S1473-3099(22)00816-7
Ryuta Uraki*, Mutsumi Ito*, Yuri Furusawa*, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Eisuke Adachi, Makoto Saito, Michiko Koga, Takeya Tsutsumi, Shinya Yamamoto, Amato Otani, Maki Kiso, Yuko Sakai-Tagawa, Hiroshi Ueki, Hiroshi Yotsuyanagi, Masaki Imai, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

Efficacy of Antiviral Agents against Omicron BQ.1.1 and XBB Subvarians 
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン版 2022年12月7日
doi:10.1056/NEJMc2214302
Masaki Imai*, Mutsumi Ito*, Maki Kiso*, Seiya Yamayoshi*, Ryuta Uraki, Shuetsu Fukushi, Shinji Watanabe, Tadaki Suzuki, Ken Maeda, Yuko Sakai-Tagawa, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Peter Halfmann, Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

【2022年11月】
In Vitro Efficacy of Antiviral Agents against the Omicron Subvariant BA.4.6
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン速報版 2022年11月16日
doi:10.1056/NEJMc2211845
Emi Takashita*, Seiya Yamayoshi*, Peter Halfmann, Nancy Wilson, Hunter Ries, Alex Richardson, Max Bobholz, William Vuyk, Robert Maddox, David A. Baker, Thomas C. Friedrich, David H. O’Connor, Ryuta Uraki, Mutsumi Ito, Yuko Sakai-Tagawa, Eisuke Adachi, Makoto Saito, Michiko Koga, Takeya Tsutsumi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Maki Kiso, Hiroshi Yotsuyanagi, Shinji Watanabe, Hideki Hasegawa, Masaki Imai, Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

Characterization of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 and BA.5 isolates in rodents
Nature オンライン版 2022年11月2日
doi:10.1038/s41586-022-05482-7
Ryuta Uraki*, Peter J. Halfmann*, Shun Iida*, Seiya Yamayoshi*, Yuri Furusawa, Maki Kiso, Mutsumi Ito, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Sohtaro Mine, Makoto Kuroda, Tadashi Maemura, Yuko Sakai-Tagawa, Hiroshi Ueki, Rong Li, Yanan Liu, Deanna Larson, Shuetsu Fukushi, Shinji Watanabe, Ken Maeda, Andrew Pekosz, Ahmed Kandeil, Richard J Webby, Zhongde Wang, Masaki Imai¶, Tadaki Suzuki¶, Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

【2022年10月】
Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 variant
Cell Host & Microbe オンライン版 2022年10月9日
doi:10.1016/j.chom.2022.10.003
齊藤暁#, 田村友和#, Jiri Zahradnik#, 出口清香#, 田畑耕史郎#, 安楽 佑樹#,木村出海#, 伊東潤平#, 山岨大智#, Hesham Nasser, 豊田真子, 永田佳代子, 瓜生慧也, 小杉優介, 藤田滋, Maya Shofa, MST Monira Begum, 清水凌, 小田義崇, 鈴木理滋, 伊藤駿, 直亨則, 王磊, 津田真寿美,吉松組子,倉持仁, 喜多俊介, 田畑香織,  福原秀雄, 前仲勝実,, 山本佑樹, 永元哲治, 浅倉弘幸, 長島真美, 貞升健志, 吉村和久, 上野貴将, Gideon Schreiber, 高折晃史, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 白川康太郎, 澤洋文, 入江崇, 橋口隆生, 高山和雄, 松野啓太, 田中伸哉*, 池田輝政*, 福原崇介*, 佐藤佳*.
（#Equal contribution; *Corresponding author）
発表論文解説

【2022年9月】
Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2 subvariants including BA.4 and BA.5
Cell オンライン版 2022年9月13日
doi:10.1016/j.cell.2022.09.018
木村出海#, 山岨大智#, 田村 友和#, 直亨則#, 鈴木干城#, 小田義崇#, 三苫修也#, 伊東潤平#, Hesham Nasser#, Jiri Zahradnik#, 瓜生慧也, 藤田滋, 小杉優介, 王磊, 津田真寿美, 岸本麻衣, 伊藤駿, 鈴木理滋, 清水凌, MST Monira Begum, 吉松組子, 木村香菜子, 佐々木 慈英, 田畑香織, 山本佑樹, 永元哲治, 金宗潤, 小檜山浩司, 浅倉弘幸, 長島真美, 貞升健志, 吉村和久, 白川康太郎, 高折晃史, 倉持仁, Gideon Schreiber, 石井健, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 橋口 隆生*, 池田輝政*, 齊藤暁*, 福原崇介*, 田中伸哉*, 松野啓太*, 佐藤佳*.
（#Equal contribution; *Corresponding author）
発表論文解説

Efficacy of Antiviral Agents against the Omicron Subvariant BA.2.75
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン速報版 2022年9月7日
doi: 10.1056/NEJMc2209952
Emi Takashita*, Seiya Yamayoshi*, Shuetsu Fukushi, Tadaki Suzuki, Ken Maeda, Yuko Sakai-Tagawa, Mutsumi Ito, Ryuta Uraki, Peter Halfmann, Shinji Watanabe, Makoto Takeda, Hideki Hasegawa, Masaki Imai, Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

【2022年8月】
Effectiveness of HEPA filters at removing infectious SARS-CoV-2 from the air
mSphere オンライン版 2022年8月10日
doi:10.1128/msphere.00086-22
Hiroshi Ueki*, Michiko Ujie*, Yosuke Komori, Tatsuo Kato, Masaki Imai, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者 
発表論文解説

The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force
Nature Communications オンライン版 2022年8月22日
doi:10.1038/s41467-022-32276-2
Wang, Q.S. et al. 
発表論文解説

Association of SARS-CoV-2 load in wastewater with reported COVID-19 cases in the Tokyo 2020 Olympic and Paralympic Village from July to September 2021
JAMA Network Open オンライン版 2022年8月22日
doi:10.1001/jamanetworkopen.2022.26822
 Masaaki Kitajima1，Michio Murakami2，Syun-suke Kadoya3，Hiroki Ando1，Tomohiro Kuroita4，Hiroyuki Katayama3，Seiya Imoto5
（1北海道大学大学院工学研究院/工学院，2大阪大学感染症総合教育研究拠点，3東京大学大学院工学系研究科，4塩野義製薬株式会社，5東京大学医科学研究所）
発表論文解説

DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-19
Nature オンライン版 2022年8月8日
doi:10.1038/s41586-022-05163-5
Namkoong H and Edahiro R et al.
発表論文解説

Cross-border transmissions of the Delta substrain AY.29 during Tokyo Olympic and Paralympic Games
Frontiers in Microbiology オンライン版 2022年 8月3日
doi:10.3389/fmicb.2022.883849
Takahiko Koyama*,  Reitaro Tokumasu, Kotoe Katayama, Ayumu Saito, Michiharu Kudo and Seiya Imoto
*責任著者
発表論文解説 【2022年7月】
Efficacy of Antibodies and Antiviral Drugs against Omicron BA.2.12.1, BA.4, and BA.5 Subvariants
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン速報版 2022年7月20日 doi:10.1056/NEJMc2207519
Emi Takashita*, Seiya Yamayoshi*, Viviana Simon, Harm van Bakel, Emilia Mia Sordillo, Andrew Pekosz, Shuetsu Fukushi, Tadaki Suzuki, Ken Maeda, Peter Halfmann, Yuko Sakai-Tagawa, Mutsumi Ito, Shinji Watanabe, Masaki Imai, Hideki Hasegawa, Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
 発表論文解説

【2022年6月】
Metalloproteinase-dependent and TMPRSS2-independent cell surface entry pathway of SARS-CoV-2 requires the furin-cleavage site and the S2 domain of spike protein
mBio オンライン版 2022年6月16日
doi:10.1128/mbio.00519-22
Mizuki Yamamoto, Jin Gohda, Ayako Kobayashi, Keiko Tomita, Youko Hirayama, Naohiko Koshikawa, Motoharu Seiki, Kentaro Semba, Tetsu Akiyama, Yasushi Kawaguchi and Jun-ichiro Inoue*
(*Corresponding author)
発表論文解説

Therapeutic efficacy of monoclonal antibodies and antivirals against SARS-CoV-2 Omicron BA.1 in Syrian hamsters
Nature Microbiology オンライン版 2022年6月15日
doi:10.1038/s41564-022-01170-4
Ryuta Uraki*, Maki Kiso*, Masaki Imai*, Seiya Yamayoshi, Mutsumi Ito, Seiichiro Fujisaki, Emi Takashita, Michiko Ujie, Yuri Furusawa, Atsuhiro Yasuhara, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yuko Sakai-Tagawa, Shinji Watanabe, Hideki Hasegawa, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

Neutralisation sensitivity of SARS-CoV-2 omicron subvariants to therapeutic monoclonal antibodies
The Lancet Infectious Diseases オンライン版 2022年6月8日
doi:10.1016/S1473-3099(22)00365-6
山岨大智#、小杉優介#、木村出海#、藤田滋、瓜生慧也、伊東潤平、The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan)、佐藤佳*（#Equal contribution; *Corresponding author）
発表論文解説

【2022年5月】
Characterization of the emerging SARS-CoV-2 B.1.621 (Mu) variant
Science Translational Medicine オンライン版 2022年5月17日
doi:10.1126/scitranslmed.abm4908
Peter J. Halfmann*, Makoto Kuroda, Tammy Armbrust, James Theiler, Ariane Balaram, Gage K. Moreno, Molly A. Accola, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Riccardo Valdez, Emily Stoneman, Katrina Braun, Seiya Yamayoshi, Elizabeth Somsen, John J. Baczenas, Keiko Mitamura, Masao Hagihara, Eisuke Adachi, Michiko Koga, Matthew McLaughlin, William Rehrauer, Masaki Imai, Shinya Yamamoto, Takeya Tsutsumi, Makoto Saito, Thomas C. Friedrich, Shelby L. O’Connor, David H. O’Conner, Aubree Gordon, Bette Korber, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

Characterization and antiviral susceptibility of SARS-CoV-2 Omicron/BA.2
Nature オンライン版 2022年5月16日
doi:10.1038/s41586-022-04856-1
Ryuta Uraki*, Maki Kiso*, Shun Iida*, Masaki Imai*, Emi Takashita*, Makoto Kuroda*, Peter J. Halfmann, Samantha Loeber, Tadashi Maemura, Seiya Yamayoshi, Seiichiro Fujisaki, Zhongde Wang, Mutsumi Ito, Michiko Ujie, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yuri Furusawa, Ryan Wright, Zhenlu Chong, Seiya Ozono, Atsuhiro Yasuhara, Hiroshi Ueki, Yuko Sakai-Tagawa, Rong Li, Yanan Liu, Deanna Larson, Michiko Koga, Takeya Tsutsumi, Eisuke Adachi, Makoto Saito, Shinya Yamamoto, Masao Hagihara, Keiko Mitamura, Tetsuro Sato, Masayuki Hojo, Shin-ichiro Hattori, Kenji Maeda, Riccardo Valdez, IASO study team, Moe Okuda, Jurika Murakami, Calvin Duong, Sucheta Godbole, Daniel C. Douek, Ken Maeda, Shinji Watanabe, Aubree Gordon, Norio Ohmagari, Hiroshi Yotsuyanagi, Michael S. Diamond, Hideki Hasegawa, Hiroaki Mitsuya, Tadaki Suzuki, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike
Cell オンライン版 2022年5月1日
doi:10.1016/j.cell.2022.04.035
山岨大智#, 木村出海#, Hesham Nasser#, 森岡佑平#, 直亨則#, 伊東潤平#, 瓜生慧也#, 津田真寿美#, Jiri Zahradnik#, 白川康太郎, 鈴木理滋, 岸本麻衣, 小杉優介, 小檜山浩司, 原哲平, 豊田真子, 田中友理, バトラー田中英里佳, 清水凌, 伊藤駿, 王磊, 小田義崇, 大場靖子, 佐々木道仁, 永田佳代子 吉松組子, 浅倉弘幸, 長島真美, 貞升健志, 吉村和久, 倉持仁, 関元昭, 藤木亮次, 金田篤志, 島田忠長, 中田孝明, 坂尾誠一郎, 鈴木拓児, 上野貴将, 高折晃史, 石井健, Gideon Schreiber, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 澤洋文, 齊藤暁*, 入江崇*, 田中伸哉*, 松野啓太*, 福原崇介*, 池田輝政*, 佐藤佳*.
（#Equal contribution; *Corresponding author）
発表論文解説
  
【2022年4月】
Efficacy of vaccination and previous infection against the Omicron BA.1 variant in Syrian hamsters
Cell Reports オンライン版 2022年3月27日
doi:10.1016/j.celrep.2022.110688
Peter J. Halfmann*¶, Makoto Kuroda, Tadashi Maemura, Shiho Chiba, Tammy Armbrust,
Ryan Wright, Ariane Balaram, Kelsey R. Florek, Allen C. Bateman, and Yoshihiro
Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

【2022年3月】
A 265-Nanometer High-Power Deep-UV Light-Emitting Diode Rapidly Inactivates SARS-CoV-2 Aerosols
mSphere オンライン版 2022年3月17日
doi:10.1128/msphere.00941-21
Hiroshi Ueki, Mutsumi Ito, Yuri Furusawa, Seiya Yamayoshi, Shin-ichiro Inoue*, and Yoshihiro Kawaoka*
発表論文解説

Correlation Analysis between Gut Microbiota Alterations and the Cytokine Response in Patients with Coronavirus Disease during Hospitalization
Microbiology Spectrum オンライン版 2022年3月7日
doi:10.1128/spectrum.01689-21
Taketoshi Mizutani, Aya Ishizaka, Michiko Koga, Kazuhiko Ikeuchi, Makoto Saito, Eisuke Adachi, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Atsuhiro Yasuhara, Hiroshi Kiyono, Tetsuro Matano, Yutaka Suzuki, Takeya Tsutsumi, Yoshihiro Kawaoka, Hiroshi Yotsuyanagi
発表論文解説

Efficacy of Antiviral Agents against the SARS-CoV-2 Omicron Subvariant BA.2
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン版 2022年3月9日 doi:10.1056/NEJMc2201933
Emi Takashita*, Noriko Kinoshita, Seiya Yamayoshi, Yuko Sakai-Tagawa, Seiichiro Fujisaki, Mutsumi Ito, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Peter Halfmann, Shinji Watanabe, Kenji Maeda, Masaki Imai, Hiroaki Mitsuya, Norio Ohmagari, Makoto Takeda, Hideki Hasegawa, Yoshihiro Kawaoka*
発表論文解説

【2022年2月】
Long-term, infection-acquired immunity against the SARS-CoV-2 Delta variant in a hamster model
Cell repots オンライン版 2022年2月15日
doi: 10.1016/j.celrep.2022.110394
 Peter J. Halfmann*, Makoto Kuroda, Tammy Armbrust, Molly Accola, Riccardo Valdez, Theresa Kowalski-Dobson, William Rehrauer, Aubree Gordon, and Yoshihiro Kawaoka*
*:責任著者
発表論文解説

COVID-19 wastewater surveillance implemented in the Tokyo 2020 Olympic and Paralympic Village
Journal of Travel Medicine オンライン版・オープンアクセス 2022年2月3日
doi:10.1093/jtm/taac004
Masaaki Kitajima1，Michio Murakami2，Ryo Iwamoto3，Hiroyuki Katayama4，Seiya Imoto5（1北海道大学大学院工学研究院，2大阪大学感染症総合教育研究拠点，3塩野義製薬株式会社，4東京大学大学院工学系研究科，5東京大学医科学研究所） 
発表論文解説

Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts tropism and fusogenicity
Nature オンライン版 2022年2月1日
doi:10.1038/s41586-022-04474-x
Bo Meng#, Isabella A.T.M Ferreira#, Adam Abdullahi#, Niluka Goonawardane#, 齊藤暁#, 木村出海#, 山岨大智#, Pehuén Perera Gerba, Saman Fatihi, Surabhi Rathore, Samantha K Zepeda, Guido Papa, Steven A. Kemp,  池田輝政, 豊田真子,  Toong Seng Tan, 倉持仁, 光永滋樹, 上野貴将, 白川康太郎, 高折晃史, Teresa Brevini, Donna L. Mallery, Oscar J. Charles, CITIID-NIHR BioResource COVID-19 Collaboration, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, Ecuador-COVID19 Consortium, John E Bowen, Anshu Joshi, Alexandra C. Walls, Laurelle Jackson, Sandile Cele, Darren Martin, Kenneth G.C. Smith, John Bradley, John A. G. Briggs, Jinwook Choi, Elo Madissoon, Kerstin Meyer, Petra Mlcochova, Lourdes Ceron-Gutierrez, Rainer Doffinger, Sarah Teichmann, Matteo Pizzuto, Anna de Marco, Davide Corti, Alex Sigal, Leo James, David Veesler, Myra Hosmillo, Joo Hyeon Lee, Fotios Sampaziotis, Ian G Goodfellow, Nicholas J. Matheson, Lipi Thukral, 佐藤佳*, Ravindra K. Gupta*
（#Equal contribution; *Corresponding author） 
発表論文解説

Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant
Nature オンライン版 2022年2月1日
doi:10.1038/s41586-022-04462-1
鈴木理滋#, 山岨大智#, 木村出海#, 王磊#, 岸本麻衣#, 伊東潤平#, 森岡佑平, 直亨則, Hesham Nasser, 瓜生慧也, 小杉優介, 津田真寿美, 大場靖子, 佐々木道仁, 清水凌, 川端涼子, 吉松組子, 浅倉弘幸, 長島真美, 貞升健志, 吉村和久, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 澤洋文, 池田輝政, 入江崇, 松野啓太*, 田中伸哉*, 福原崇介*, 佐藤佳*.
（#Equal contribution; *Corresponding author）
発表論文解説

【2022年1月】
CRISPR-Cas3-based diagnostics for SARS-CoV-2 and influenza virus
iScience オンライン版 2022年1月30日
doi:10.1016/j.isci.2022.103830
Kazuto Yoshimi, Kohei Takeshita, Seiya Yamayoshi, Satomi Shibumura, Yuko Yamauchi, Masaki Yamamoto, Hiroshi Yotsuyanagi, Yoshihiro Kawaoka, Tomoji Mashimo
発表論文解説  

Efficacy of antibodies and antivirals against a SARS-CoV-2 Omicron variant
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン速報版 2022年1月26日 doi:10.1056/NEJMc2119407
Emi Takashita, Noriko Kinoshita, Seiya Yamayoshi, Yuko Sakai-Tagawa, Seiichiro Fujisaki, Mutsumi Ito, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Shiho Chiba, Peter Halfmann, Hiroyuki Nagai, Makoto Saito, Eisuke Adachi, David Sullivan, Andrew Pekosz, Shinji Watanabe, Kenji Maeda, Masaki Imai, Hiroshi Yotsuyanagi, Hiroaki Mitsuya, Norio Ohmagari, Makoto Takeda, Hideki Hasegawa, Yoshihiro Kawaoka 
発表論文解説

SARS-CoV-2 Omicron virus causes attenuated disease in mice and hamsters
Nature オンライン速報版 2022年1月21日
ⅾoi:10.1038/s41586-022-04441-6
Peter J. Halfmann*, Shun Iida*, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto*, Tadashi Maemura*, Maki Kiso*, Suzanne M. Scheaffer, Tamarand L. Darling, Astha Joshi, Samantha Loeber, Gagandeep Singh, Stephanie L. Foster, Baoling Ying, James Brett Case, Zhenlu Chong, Bradley Whitener, Juan Moliva, Katharine Floyd, Michiko Ujie, Noriko Nakajima, Mutsumi Ito, Ryan Wright, Ryuta Uraki, Prajakta Warang, Matt Gagne, Rong Li, Yuko Sakai-Tagawa, Yanan Liu, Deanna Larson, Jorge E. Osorio, Juan P. Hernandez-Ortiz, Amy R. Henry, Karl Ciouderis, Kelsey Florek, Mit Patel, Abby Odle, Lok-Yin Roy Wong, Allen C. Bateman, Zhongde Wang, Venkata-Viswanadh Edara, Zhenlu Chong, John Franks, Trushar Jeevan, Thomas Fabrizio, Jennifer DeBeauchamp, Lisa Kercher, Patrick Seiler, Ana Silvia Gonzalez-Reiche, Emilia Mia Sordillo, Lauren A Chang, Harm van Bakel, Viviana Simon, PSP study group, Daniel C. Douek, Nancy J. Sullivan, Larissa B. Thackray, Hiroshi Ueki, Seiya Yamayoshi, Masaki Imai, Stanley Perlman, Richard J. Webby, Robert A. Seder, Mehul S. Suthar, Adolfo Garcia-Sastre, Michael Schotsaert, Tadaki Suzuki, Adrianus C.M. Boon¶, Michael S. Diamond¶, and Yoshihiro Kawaoka¶
*:筆頭著者
¶:責任著者
発表論文解説

【2021年12月】
The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance
Cell Reports オンライン版 2021年12月18日
doi:10.1016/j.celrep.2021.110218
木村出海#, 小杉優介#, 呉佳齊#, Jiri Zahradnik, 山岨大智, バトラー田中英里佳, 田中友理, 瓜生慧也, Yafei Liu, 森迫奈菜実, 白川康太郎, 数馬安浩, 野村亮介, 堀澤欣史, 徳永研三, 上野貴將, 高折晃史, Gideon Schreiber, 荒瀬尚, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 本園千尋, 齊藤暁, 中川草*, 佐藤佳*$
（#Equal contribution; *Corresponding authors；＄Lead contact） 
発表論文解説

【2021年11月】
Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation
Nature オンライン版 2021年11月25日（英国時間）
doi:10.1038/s41586-021-04266-9
齊藤暁#, 入江崇#, 鈴木理滋#, 前村忠#, Hesham Nasser#, 瓜生慧也#, 小杉優介#, 白川康太郎, 貞升健志, 木村出海, 伊東潤平, 呉佳齊, 岩附研子, 伊藤睦美, 山吉誠也, Samantha Loeber, 津田真寿美, Lei Wang, 大園誠也, バトラー田中英里佳, 田中友理, 清水凌, 清水健太, 吉松組子, 川端涼子, 坂口剛正, 徳永研三, 吉田勲, 浅倉弘幸, 長島真美, 数馬安浩, 野村亮介, 堀澤欣史, 吉村和久, 高折晃史, 今井正樹, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 田中伸哉*, 中川草*, 池田輝政*, 福原崇介*, 河岡義裕*, 佐藤佳*
（#Equal contribution; *Corresponding author） 
発表論文解説
  発表論文解説

【2021年9月】
SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion
Nature オンライン版 2021年9月6日
doi:10.1038/s41586-021-03944-y
Petra Mlcochova*, Steven Kemp*, Mahesh Shanker Dhar*, Guido Papa, Bo Meng, Isabella A.T.M Ferreira, Rawlings Datir, Dami A. Collier, Anna Albecka, Sujeet Singh, Rajesh Pandey, Jonathan Brown, Jie Zhou, Niluka Goonawardane, Swapnil Mishra, Charles Whittaker, Thomas Mellan , Robin Marwal, Meena Datta, Shantanu Sengupta, Kalaiarasan Ponnusamy, Venkatraman Srinivasan Radhakrishnan, Adam Abdullahi, Oscar Charles, Partha Chattopadhyay, Priti Devi, Daniela Caputo, Tom Peacock, Dr Chand Wattal, Neeraj Goel, Ambrish Satwik, Raju Vaishya, Meenakshi Agarwal, The Indian SARS-CoV-2 Genomics Consortium (INSACOG), The CITIID-NIHR BioResource COVID-19 Collaboration, 
The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, Antranik Mavousian, Joo Hyeon Lee, Jessica Bassi , Chiara Silacci-Fegni, Christian Saliba, Dora Pinto , 入江 崇, 吉田 勲, William L. Hamilton, 佐藤 佳, Samir Bhatt, Seth Flaxman, Leo C. James, Davide Corti, Luca Piccoli, Wendy S. Barclay, Partha Rakshit*, Anurag Agrawal*, Ravindra K. Gupta*
発表論文解説

【2021年7月】
Inactivation of Novel Coronavirus and Alpha Variant by Photo-renewable CuxO/TiO2 Nanocomposites
ChemRxiv オンライン版 2021年7月16日
doi:10.33774/chemrxiv-2021-tnrs7 
Tetsu Tatsuma, Makoto Nakakido, Takeshi Ichinohe, Yoshinori Kuroiwa, Kengo Tomioka, Chang Liu, Nobuhiro Miyamae, Tatsuya Onuki, Kouhei Tsumoto, Kazuhito Hashimoto, Toru Wakihara
発表論文解説

SARS-CoV-2 B.1.617 mutations L452R and E484Q are not synergistic for antibody evasion
Journal of Infectious Diseases オンライン版 2021年7月14日
doi:10.1093/infdis/jiab368 
Isabella Ferreira#, Steven Kemp#, Rawlings Datir#, 齊藤暁, Bo Meng, Partha Rakshit, 高折晃史, 小杉優介, 瓜生慧也, 木村出海, 白川康太郎, Adam Abdullahi, The CITIID-NIHR BioResource COVID-19 Collaboration, The Indian SARS-CoV-2 Genomics Consortium (INSACOG), Anurag Agarwal, 大園誠也, 徳永研三, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 佐藤佳*, Ravindra K. Gupta*（#Equal contribution; *Corresponding authors） 
発表論文解説 

Mapping the human genetic architecture of COVID-19
Nature オンライン版 2021年7月8日
doi:10.1038/s41586-021-03767-x
The COVID-19 Host Genetics Initiative
発表論文解説

【2021年6月】
The human microbiome and COVID-19: A systematic review
PLoS One 2021 Jun 23;16(6):e0253293
doi:10.1371/journal.pone.0253293
Yamamoto S, Saito M, Tamura A, Prawisuda D, Mizutani T, Yotsuyanagi H 
COVID-19とヒトマイクロバイオームのシステマティックレビュー。
便検体と呼吸器検体でopportunistic pathogensの増加及びdysbiosis が認められる事を示した報告。

Characterization of a new SARS-CoV-2 variant that emerged in Brazil
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America オンライン版 2021年6月17日
doi:10.1073/pnas.2106535118
Masaki Imai*, Peter J. Halfmann, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Shiho Chiba, Tokiko Watanabe, Noriko Nakajima, Mutsumi Ito, Makoto Kuroda, Maki Kiso, Tadashi Maemura, Kenta Takahashi, Samantha Loeber, Masato Hatta, Michiko Koga, Hiroyuki Nagai, Shinya Yamamoto, Makoto Saito, Eisuke Adachi, Osamu Akasaka, Morio Nakamura, Ichiro Nakachi, Takayuki Ogura, Rie Baba, Kensuke Fujita, Junichi Ochi, Keiko Mitamura, Hideaki Kato, Hideaki Nakajima, Kazuma Yagi, Shinichiro Hattori, Kenji Maeda, Tetsuya Suzuki, Yusuke Miyazato, Riccardo Valdez, Carmen Gherasim, Yuri Furusawa, Moe Okuda, Michiko Ujie, Tiago J. S. Lopes, Atsuhiro Yasuhara, Hiroshi Ueki, Yuko SakaiTagawa, Amie J. Eisfeld, John J. Baczenas, David A. Baker, Shelby L. O’Connor, David H. O’Connor, Shuetsu Fukushi, Tsuguto Fujimoto, Yudai Kuroda, Aubree Gordon, Ken Maeda, Norio Ohmagari, Norio Sugaya, Hiroshi Yotsuyanagi, Hiroaki Mitsuya, Tadaki Suzuki, Yoshihiro Kawaoka*
発表論文解説

SARS-CoV-2 spike L452R variant evades cellular immunity and increases infectivity
Cell Host & Microbe オンライン版 2021年6月14日
doi:10.1016/j.chom.2021.06.006 
本園千尋, 豊田真子#, Jiri Zahradnik#, 齊藤暁#, Hesham Nasser#, Toong Seng Tan, Isaac Ngare, 木村出海, 瓜生慧也, 小杉優介, Yuan Yue, 清水凌, 伊東潤平, 鳥居志保, 米川晶子, 下野信行, 長﨑洋司, 南留美, 遠矢嵩, 関谷紀貴, 福原崇介, 松浦善治, Gideon Schreiber, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 池田輝政*, 中川草*, 上野貴将*, 佐藤佳*（#Equal contribution; *Corresponding authors）
発表論文解説

N-(4-Hydroxyphenyl) retinamide suppresses SARS-CoV-2 spike protein-mediated cell-cell fusion by a dihydroceramide Δ4-desaturase 1-independent mechanism
Journal of Virology オンライン版 2021年6月9日
doi:10.1128/JVI.00807-21
Hayashi Y, Tsuchiya K, Yamamoto M, Nemoto-Sasaki Y, Tanigawa K, Hama K, Ueda Y, Tanikawa T, Gohda J, Maeda K, Inoue J, Yamashita A
発表論文解説

【2021年3月】
COVID-19 risk assessment at the opening ceremony of the Tokyo 2020 Olympic Games
Microbial Risk Analysis オンライン版 2021年3月21日
doi:10.1016/j.mran.2021.100162
村上道夫*、三浦郁修、北島正章、藤井健吉、保高徹生、岩崎雄一、小野恭子、島津勇三、空野すみれ、奥田知明、尾崎章彦、片山琴絵、西川佳孝、小橋友理江、澤野豊明、阿部暁樹、斎藤正也、坪倉正治、内藤航、井元清哉（* 責任著者）
発表論文解説

Sarbecovirus ORF6 proteins hamper the induction of interferon signaling
Cell Reports オンライン版 March 12, 2021
doi:10.1016/j.celrep.2021.108916
木村出海, 今野順介, 瓜生慧也, Kristina Hopfensperger, Daniel Sauter, 中川草, 佐藤佳* (*corresponding author)
発表論文解説

Increased risk of rhinovirus infection in children during the coronavirus disease-19 pandemic
Influenza and Other Respiratory Viruses オンライン版：2021;00:1–7.
doi:10.1111/irv.12854
Emi Takashita, Chiharu Kawakami, Tomoko Momoki, Miwako Saikusa, Kouhei Shimizu, Hiroki Ozawa, Makoto Kumazaki, Shuzo Usuku, Nobuko Tanaka, Ichiro Okubo, Hiroko Morita, Shiho Nagata, Shinji Watanabe, Hideki Hasegawa, Yoshihiro Kawaoka
発表論文解説

【2021年2月】
Antibody titers against SARS-CoV-2 decline, but do not disappear for several months
EClinicalMedicine オンライン版 Volume 32, February 2021, 100734
doi：10.1016/j.eclinm.2021.100734
Seiya Yamayoshi*, Atsuhiro Yasuhara, Mutsumi Ito, Osamu Akasaka, Morio Nakamura, Ichiro Nakachi, Michiko Koga, Keiko Mitamura, Kazuma Yagi, Kenji Maeda, Hideaki Kato, Masanori Nojima, David Pattinson, Takayuki Ogura, Rie Baba, Kensuke Fujita, Hiroyuki Nagai, Shinya Yamamoto, Makoto Saito, Eisuke Adachi, Junichi Ochi, Shin-ichiro Hattori, Tetsuya Suzuki, Yusuke Miyazato, Shiho Chiba, Moe Okuda, Jurika Murakami, Taiki Hamabata, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Hideaki Nakajima, Hiroaki Mitsuya, Norio Omagari, Norio Sugaya, Hiroshi Yotsuyanagi, and Yoshihiro Kawaoka*（*責任著者）
発表論文解説

【2021年1月】
【2020年11月】

SARS-CoV-2 D614G Variant Exhibits Efficient Replication ex vivo and Transmission in vivo
Science オンライン版 2020年11月12日 doi:10.1126/science.abe8499
Yixuan J. Hou, Shiho Chiba, Peter Halfmann, Camille Ehre, Makoto Kuroda, Kenneth H Dinnon III, Sarah R. Leist, Alexandra Schäfer, Noriko Nakajima, Kenta Takahashi, Rhianna E. Lee, Teresa M. Mascenik, Rachel Graham, Caitlin E. Edwards, Longping V. Tse, Kenichi Okuda, Alena J. Markmann, Luther Bartelt, Aravinda de Silva, David M. Margolis, Richard C. Boucher, Scott H. Randell, Tadaki Suzuki, Lisa E. Gralinski, Yoshihiro Kawaoka* and Ralph S. Baric* (*corresponding author)
発表論文解説

コロナ禍におけるリスクコミュニケーションと偏見・差別
月刊福祉, 103(10):15-18, 全国社会福祉協議会, 2020/11. 
武藤 香織

【2020年10月】

Effectiveness of face masks in preventing airborne transmission of SARS-CoV-2
mSphere オンライン版 2020年10月21日 doi:10.1128/mSphere.00637-20
Hiroshi Ueki, Yuri Furusawa, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Masaki Imai, Hiroki Kabata, Hidekazu Nishimura, and Yoshihiro Kawaoka* (*corresponding author) 
発表論文解説

The association of coagulopathy with liver dysfunction in patients with COVID-19  
Hepatol Res.  doi:10.1111/hepr.13577
Tsutsumi T, Saito M, Nagai H, Yamamoto S, Ikeuchi K, Lim LA, Adachi E, Koga M, Okushin K, Akai H, Kunimatsu A, Yotsuyanagi H.  (東京大学医科学研究所感染症分野)
COVID-19における肝機能障害に関与する因子について調べた報告。

「新型コロナ専門家有志の会」の全世代に向けた情報発信の活動より
保健の科学, 62(10); 652-657, 2020/10.
武藤 香織, 仁木 崇嗣, 田中 幹人

Antibody Response to SARS-CoV-2 in people living with HIV  
Journal of Microbiology, Immunology and Infection  doi:10.1016/j.jmii.2020.09.005
Yamamoto S, Saito M, Nagai E, Toriuchi K, Nagai H, Yotsuyanagi H, Nakagama Y, Kido Y, Adachi E. (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科、大阪市立大学大学院医学研究科寄生虫学)
HIV感染者における新型コロナウイルス感染症の抗体産性について調べた報告。

【2020年9月】

Seroconversion against SARS-CoV-2 occurred after the recovery in patients with COVID-19  
Journal of Medical Virology  2020年9月8日  doi:10.1002/jmv.26495.
Yamamoto S, Saito M, Nagai E, Toriuchi K, Nagai H, Yotsuyanagi H, Nakagama Y, Kido Y, Adachi E. (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科、大阪市立大学大学院医学研究科寄生虫学)
新型コロナウイルス感染症の臨床経過と血清抗体価の経時的推移を比較した報告。

Professional Commitment to Ethical Discussions Needed From Epidemiologists in the COVID-19 Pandemic
Journal of Epidemiology, 30(9); 375 – 376.2020, doi: https://doi.org/10.2188/jea.JE20200278
Kenji Matsui, Keiichiro Yamamoto, Yusuke Inoue. 
COVID-19パンデミック下で疫学者に求められる倫理的議論への関与について。

SARS-CoV-2 ORF3b Is a Potent Interferon Antagonist Whose Activity Is Increased by a Naturally Occurring Elongation Variant
Cell Reports オンライン版  2020年9月4日  doi:10.1016/j.celrep.2020.108185
Yoriyuki Konno#, Izumi Kimura#, Keiya Uriu, Masaya Fukushi, Takashi Irie, Yoshio Koyanagi, Daniel Sauter, Robert J. Gifford, USFQ-COVID19 consortium, So Nakagawa, Kei Sato* (#Equal contribution; *corresponding author)　
発表論文解説

【2020年8月】

Infiltrative Shadows in COVID-19: Pneumonia or Pulmonary Embolism?  
Internal Medicine  2020年8月12日  doi:10.2169/internalmedicine.5380-20
Nagai H, Yamamoto S, Saito M, Adachi E. (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科)
新型コロナウイルス患者でのCT検査における肺浸潤影の鑑別として肺動脈血栓塞栓症の可能性を考慮する必要性を論じた臨床写真付き症例報告。

COVID-19パンデミック下の人工呼吸器トリアージ問題にどう取り組むべきかー学際的協働に向けた医事法学からのアプローチ
病院 79(8); 610-616，2020/8．
一家 綱邦, 船橋 亜希子.

対話を通じ共通目標の模索を
新聞研究, 827:34-35, 日本新聞協会, 2020/8.
武藤 香織

【2020年7月】

Cases of coronavirus disease-2019 in HIV-infected transgender women
AIDS   2020年7月15日  doi:10.1097/QAD.0000000000002573
Adachi E, Saito M, Ikeuchi K, Hoshina T, Yotsuyanagi H.  (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科、東京慈恵会医科大学附属病院)
トランスジェンダー女性のHIV感染者における新型コロナウイルス感染症の感染リスク因子と臨床経過についての考察。

Relative Bradycardia in Patients with Mild-to-Moderate Coronavirus Disease, Japan  
Emerging infectious diseases  2020年7月1日  doi:10.3201/eid2610.202648 
Ikeuchi K, Saito M, Yamamoto S, Nagai H, Adachi E. (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科)
新型コロナウイルス感染症で入院した54例の体温、脈拍数を解析し、比較的徐脈が認められることを示した報告。

【2020年6月】

Syrian hamsters as a small animal model for SARS-CoV-2 infection and countermeasure development
Proc Natl Acad Sci USA オンライン版 2020年6月22日　doi:10.1073/pnas.2009799117
Masaki Imai, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Masato Hatta, Samantha Loeber, Peter J. Halfmann, Noriko Nakajima, Tokiko Watanabe, Michiko Ujie, Kenta Takahashi, Mutsumi Ito, Shinya Yamada, Shufang Fan, Shiho Chiba, Makoto Kuroda, Lizheng Guan, Kosuke Takada, Tammy Armbrust, Aaron Balogh, Yuri Furusawa, Moe Okuda, Hiroshi Ueki, Atsuhiro Yasuhara, Yuko Sakai-Tagawa, Tiago J. S. Lopes, Maki Kiso, Seiya Yamayoshi, Noriko Kinoshita, Norio Ohmagari, Shin-ichiro Hattori, Makoto Takeda, Hiroaki Mitsuya, Florian Krammer, Tadaki Suzuki, Yoshihiro Kawaoka. 
発表論文解説

The Anticoagulant Nafamostat Potently Inhibits SARS-CoV-2 S protein-Mediated Fusion in a Cell Fusion Assay System and Viral Infection In Vitro in a Cell-Type-Dependent Manner
Viruses, 2020 Jun 10;12(6):629. doi:10.3390/v12060629
Mizuki Yamamoto, Maki Kiso, Yuko Sakai-Tagawa, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Msaki Imai, Makoto Takeda, Noriko Kinoshita, Norio Omagari, Jin Gohda, Kentaro Semba, Zene  Matsuda, Yasushi Kawaguchi, Yoshihiro Kawaoka, Jun-ichiro Inoue.
膵炎治療薬ナファモスタット が新型コロナウイルスのヒト気道上皮細胞への侵入を阻害することによってウイルス感染を強力に抑制することを発見した報告。

Japanese citizens' behavioral changes and preparedness against COVID-19: An online survey during the early phase of the pandemic
PLOS ONE,  15(6); e0234292, 2020/6, doi:10.1371/journal.pone.0234292
Kaori Muto, Isamu Yamamoto, Miwako Nagasu, Mikihito Tanaka, Koji Wada. 
COVID-19パンデミック初期段階における日本人の行動の変化と準備に関するオンライン調査。

Rapid and accurate detection of novel coronavirus SARS-CoV-2 using CRISPR-Cas3
medRxivew  2020年6月2日  doi:10.1101/2020.06.02.20119875
Kazuto Yoshimi, Kohei Takeshita, Seiya Yamayoshi, Satomi Shibumura, Yuko Yamauchi, Masaki Yamamoto, Hiroshi Yotsuyanagi, Yoshihiro Kawaoka, Tomoji Mashimo. 
発表論文解説

【2020年5月】

Transmission of SARS-CoV-2 in Domestic Cats
New England Journal of Medicine (NEJM) オンライン版 2020年5月13日 doi:10.1056/NEJMc2013400
Peter J. Halfmann, Masato Hatta, Shiho Chiba, Tadashi Maemura, Shufang Fan, Makoto Takeda, Noriko Kinoshita, Shin-ichiro Hattori, Yuko Sakai-Tagawa, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Masaki Imai, Yoshihiro Kawaoka.
発表論文解説

【2020年4月】

Gargle Lavage as a Safe and Sensitive Alternative to Swab Samples to Diagnose COVID-19: A Case Report in Japan
Clinical Infectious Diseases  2020年4月2日  doi:10.1093/cid/ciaa377
Saito M, Adachi E, et al. (東京大学医科学研究所附属病院感染免疫内科)
新型コロナウイルス感染症の診断に際して咽頭うがい液検体によるPCR検査の有用性についての報告。