ゲノム・マルチオミクス統合解析による造血器疾患の病態解明

私たちは、急性リンパ性白血病や悪性リンパ腫をはじめとした造血器疾患の臨床検体コホートを用いて、全ゲノムシーケンス解析を行っています。検体から得られたゲノム情報をもとに、点変異、コピー数異常、構造異常などを網羅的に解析し、病態や臨床像に関わる可能性のあるゲノム異常の抽出を進めています。

また、自験例の解析に加えて、公共データとして公開されている全ゲノムシーケンス、RNA-seq、シングルセルRNA-seq、Hi-Cなどのデータも活用し、自験例で得られた候補異常を多層的なデータと照合しながら解析しています。

さらに、ショートリードシーケンスでは解釈が難しい複雑な構造異常や融合遺伝子、非コード領域の異常については、ロングリードシーケンスを追加し、異常の全体像やブレイクポイント構造をより詳細に評価しています。

このプロジェクトでは、シーケンス解析によって候補となる異常を同定するだけでなく、抽出された異常の生物学的・病態生理学的意義を実験的に検証することを重視しています。ヒトiPS細胞や細胞株を用いた機能解析実験を行い、候補異常が細胞増殖、分化、シグナル伝達、薬剤応答などに与える影響を評価しています。

・Sakashita M, Kanda J, Hattori K, et al. Pre-transplant molecular international prognostic scoring system score reduction is not associated with improved outcomes in myelodysplastic syndromes. Blood Cancer J. 2026 in press.

・Takamori H, Ueda Y, Matsuoka Y, et al. Lifelong phylogenetic reconstruction of immune-mediated clonal trajectories in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria. Leukemia. 2026 July 13, in press.

・Chonabayashi K, Iwasaski M, Kanda J, et al. NUP98 rearrangements in adult AML patients: evaluation of clinical implications and identification of novel fusion partners. Leukemia. 2026 Mar;40(3):491-501.

・Takamori H, Huang YJ, Fukushima H, et al. Whole-genome sequencing of myeloproliferative neoplasms revealed dynamic clonal changes in the fibrotic or leukemic transformation and novel FOXP1 mutations in the fibrotic transformation. Leukemia. 2025 May;39(5):1218-1227.

・Ikoma Y, Nakamura N, Kaneda Y, et al. Impact of myelodysplasia-related gene mutations and residual mutations at remission in venetoclax/azacitidine for AML. Leukemia. 2025 Jun;39(6):1362-1367.