2013.05.01 2013年9月16 - 17日の2日間、The First International Aizu Conference on Biomedical Informatics and Technology(ACBIT’2013)と題する国際会議を会津大学で開催します(http://web-ext.u-aizu.ac.jp/conference/acbit/)。本国際会議は生物学、物理学、工学、数学など様々な学問分野の研究者が一堂に会し、異なる立場、異なる言語、異なる価値観の壁を乗り越え、学際的な交流を図ることを目的としています。ふるっての講演・ポスター発表、及び参加をお待ちしています。
2013.04.20 下記の論文がacceptされました。
Watanabe, A., Hosino D., Koshikawa, N., Seiki, M., Suzuki, T., and Ichikawa, K., "Critical role of transient activity of MT1-MMP for ECM degradation in invadopodia", PLoS Comp. Biol.
2013.04.16 2013年7月3 - 7日、大阪国際会議場で開催される第35回IEEE EMBC (http://embc2013.embs.org/) において当研究室がオーガナイザーを務める "Full-day Workshop on Current Challenging Image Analysis"を開催します。複雑な実細胞空間構造における転写因子NF-κBのシグナル伝達シミュレーションなどについて発表と討論が行われます。ふるってのご参加をお待ちしています。
2012.01.17 細胞内シグナル伝達のA-Cellモデル構築ガイドを公開しました。A-Cellモデルのつくり方を解説しています。コチラから御覧ください(修飾シグナル病HPに移動します)。
2012.10.04 下記の論文が掲載されました。Ohshima, D., Inoue, J., Ichikawa, K., "Roles of Spatial Parameters on the Oscillation of Nuclear NF-κB: Computer Simulations of a 3D Spherical Cell", PLoS ONE., 7(10): e46911 (2012). この論文で使った数理モデルはA-Cellモデル集のページからダウンロードできます。
2012.06.14 A-Cell 3Dを含む新しいA-Cell(Java版)をリリースしました。3Dモデルのサンプルは A-Cellモデル集のページからダウンロードできます。また,A-Cell利用説明書もダウンロードできるようになりました。
2012.04.23 下記の論文が掲載されました。 Hoshino, D., Koshikawa, N., Suzuki,T., Quaranta, V., Weaver, A.M., Seiki, M. and Ichikawa, K., "Establishment and validation of computational model for MT1-MMP dependent ECM degradation and intervention strategies", PLoS Comp.Biol., Vol.8 (2012), e1002479. この論文で使った数理モデルはA-Cellモデル集のページからダウンロードでき ます。
2012.03.24 下記レビューが掲載されました。
大島大輔/市川一寿、「核内NF-κBの振動とその制御の数理モデル」、実験医学増刊、Vol.30、No5、pp.49-55。2012
2012.03.19 A-Cell(Java版)で動作するサンプルモデルをリリースしました。 A-Cellモデル集のページからダウンロードできます。
2012.03.19 A-Cell(Java版)のバグ(Hodgkin-Huxleyのモデル構築での不具合) の修正を行い、リリースしました。
2012.03.13 下記の論文がin pressになりました。 Hoshino, D., Koshikawa, N., Suzuki,T., Quaranta, V., Weaver, A.M., Seiki, M. and Ichikawa, K., "Establishment and validation of computational model for MT1-MMP dependent ECM degradation and intervention strategies", PLoS Comp.Biol. (in Press). この論文で使ったA-Cellモデル集のページからダウンロードできます。
2012.02.28 A-Cell(Java版)をリリースしました。本バージョンでは、Javaを用いることにより、プラットフォームに依存せずにご利用いただけるようになりました。実験系の研究者でご利用の多いMac OSでもお使いいただけます。こちらからダウンロードしてください。
3Dシミュレーションが可能なA-Cell 3Dは近日公開予定です。
2011.11.11 10月16日から19日までアメリカ合衆国ボルチモアにてAmerican Association of Cancer Research(AACR)の特別会議"Metabolism and Cancer"が開催されました。世界各地から研究者が集まり最新の研究成果が発表され、活発な議論が展開されました。会議の様子はこちら(PDFファイル525KB)をご覧ください。
2011.07.04 6月8,9日の2日間に渡って広島大学で国際会議「がん細胞の数理科学」を
開催しました。数理科学と細胞生物学の異分野研究者が一堂に会し、活発な議
論が行われました。会議の様子はこちら(PDFファイル234KB)をご覧ください。
2011.04.01 2011年4月1日より新しいメンバー(特別研究員(日本学術振興会特別研究員(PD)・渡部綾子さん、および特任研究員・大島大輔さん)が加わりました。
2011.02.26 下記の論文がアクセプトされました。
Ichikawa, K., Rouzimaimaiti, M., Suzuki, T., “Reaction diffusion equation with non-local term arises as a mean field limit of the master equation”, Discrete and Continuous Dynamical Systems Series S (accepted).
2011.01.28 下記の論文が公開になりました。
Ichikawa, K., Suzuki, T., and Murata, T., “Stochastic simulation of biological reactions, and its applications for studying actin polymerization”, Physical Biol., Vol.7 (2010), 046010.
2010.12.17 ホームページを公開しました。

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