本基地由东京大学“促进优秀青年科学家独立研究计划”管理, 该计划已被部科学省科技振兴调整费“支持青年科学家独立研究工程”所采用。在与东大项目运营委员会协调的同时，医科学研究所内设置项目管理办公室，为该项目研究人员（现研究组组长2名及研究人员3名）的活动提供各种保障。医科学研究的教授为他们提供指导。