细胞的癌化以及恶性化的过程与多种癌症有关基因的变异和表达变化有关。本部门以癌症基因、抑癌基因等癌症有关基因功能分析为基础，阐明有关癌症的发生和发展的分子机制。其中重点放在细胞周期的控制和细胞运动及黏附功能的控制上，对有关细胞增生和分化的细胞内信息传达进行分析。另外就影响癌症发展的血管新生的分子机制、癌细胞浸润以及癌症转移的机理，进行基因以及蛋白质水平的研究。具体研究课题如下:

(1) 癌基因及抑癌基因的功能分析
(2) 有关癌细胞的增生和分化的信号传达机制和基因表达调控机制的阐明
(3) 有关肿瘤血管新生、癌细胞浸润、癌症转移等癌症恶性化的分子机制的阐明
(4) 控制癌细胞运动的分子机制的阐明
(5) 基于基因组分析的致癌分子机制的阐明